Ergenekon'un kara kutusu Tuncay Güney'in MİT tarafından örgütün içine yerleştirildiği ortaya çıktı. Sabah gazetesinden Abdurrahman Şimşek'in haberine göre, Güney MİT'e çok genç yaşlarda, MİT İstanbul Bölge Başkanı Galip Tuğcu tarafından kazandırıldı. 1990'lı yıllarda önce "Gerici Faaliyetler Şubesi" sonra da İran Masası'na bağlı çalışan Güney, bu amaçla genç bir gazeteci kimliğiyle, Ortadoğu'daki liderlerle yüzyüze görüşmeler yaptı.
VELİ KÜÇÜK VE JİTEM GÖREVİ
MİT belgesine yer verilen habere göre, 1992'de MİT, Güney'in görevini değiştirdi. JİTEM ve Ergenekon'a sızma görevi verilen Güney, albay rütbesiyle Ağrı'da görev yapan Veli Küçük ile tanıştı. 1996-97 yıllarında Susurluk skandalı sırasında MİT için önemli bir bilgi kaynağı olan Güney, hem Susurluk hem de 28 Şubat sürecinde elde ettiği bilgileri, MİT'in çalışma merkezi olarak kullandığı İstanbul Dolmabahçe Sarayı Harem Dairesi'ne götürüyordu.
ABD VİZESİ ATASAGUN'DAN
Ancak Güney'in kimliği 2001'de dönemin İstanbul Organize Suçlar Şubesi Müdürü Adil Serdar Saçan tarafından yapılan sorguda deşifre edildi. İddiaya göre Güney'in JİTEM kimliğinin deşifre olmasını istemeyen Küçük, Güney'in serbest kalmasını sağladı. Tam bu noktada MİT de devreye girdi. MİT Müsteşarı Şenkal Atasagun, CİA ile temas kurarak Güney'e 10 yıllık ABD vizesi aldı. MİT İstanbul Bölge Başkanı Kubilay Günay'ın ekibi eşliğinde New York'a gönderildi. ABD'de Güney'i karşılayanlar onu Manhattan'daki The Marmara Oteli'ne yerleştirdi. Bir hafta sonra ise Türk istihbaratının kullandığı bir daireye geçti ve 1 yıl boyunca burada yaşadı.
MİT mensubu olduğu belgelenen Tuncay Güney'in babası Ali Güney'in de teknisyen kimliğiyle Mehmet Eymür'ün yanında görev aldığını ilk Yeni Şafak yazmıştı. Güney "Babamın cenazesinde siyah takım elbiseli kravatlı adamlar vardı' demişti.
MİT: Belge doğru
MİT Tuncay Güney'in kurum adına çalıştığını gösteren belgenin doğru olduğunu ancak haber elemanı olarak kullanılmadığını açıkladı. MİT'in Sabah gazetesinin haberini yalanlarken verdiği mesajlar dikkat çekti:
GAYRI RESMİ ELEMAN MI?
"Haberde yer alan belge teşkilâtımıza aittir. Söz konusu belgenin dışarıya yansıtılması ile ilgili idarî soruşturma açılmıştır. Tuncay Güney o dönem itibarıyla şüpheli faaliyetlerinden dolayı dikkatimizi çeken ve üzerinde çalışma yapılan bir şahıstır. Bu bağlamda, Tuncay Güney kayıtlı bir haber kaynağımız değildir.'
Açıklamada, Güney'in MİT'in haber elamanı olduğu yalanlanırken 'kayıtlı' haber elemanı olmadığının vurgulanması dikkat çekti. Belgenin doğru olduğunun vurgulanması ise 'Güney MİT için gayri resmi olarak çalışmış' şeklinde yorumlandı.
EYMÜR'E DOLAYLI SUÇLAMA
'Kuruluş ve işleyişi tartışmalı olan Kontrterör Merkezi, sorumluları ile birlikte 1997 yılında kuruluş şemasından çıkarılmıştır'
Haberle doğrudan ilgisi olmayan Kontrterör Merkezi'nin lağvedildiğinin vurgulanması dikkat çekiyor. O dönemde bu birimin başında Mehmet Eymür bulunuyordu. Güney 2001'deki ifadelerinde Eymür'ün adamlarıyla sık sık görüştüğünü söylemişti. Açıklamadaki bu ifadeler Eymür'e dolaylı yoldan suçlama olarak yorumlandı